制度几十年不到就失效了。这也正是他没有将行政与司法权完全分开造成的！
这次朱祁钰做得很彻底。要完全将行政与司法权分开最直接也是最重要的办法就是提高司法部门的地位。以往监察院的最高官员也就是四品而大理寺卿也是四品比起各部尚书侍郎都差得很远。让四品官员去调查二品官员这本身就不现实！另外司法机构中执法检察审查三权并没有分开因此司法程序并不完善。最重要的是执法大权掌握在政府官员手里也就是行政官员手里就算是审查与检察这两关能够做好执法不到位那也是白搭！
朱祁钰将监察院改为了检察院并且将检察院主检察长提升为正二品官员由权调查政府一切官员。另外将大理寺改组为最高法院主掌审查权任何重大案件都必须经大理寺审核才能最终定案。而大理寺卿也被提升为正二品极大的提高了司法机构的权威！
最重要的是朱祁钰将执法权从地方行政官员手里夺了下来单独成立执法部门即警察总局！最初的警察人选其实就是从锦衣卫里挑出来的。另外还在政府中专门设立了警察部（后改名公安部）。这就让执法这一层成为了司法与行政两大机构中的一个过渡部门执法官员既是行政官员也是司法官员其双重身份决定了其重要性！
成立了最高法院（下直属各省府县地方法院）最高检察院（下直属各省府县地方检察院）警察部之后朱祁钰就已经将行政与司法完全分开了。而这对当时的朝廷官员（也就是后来的行政官员）来说绝不见得是件好事。毕竟多年以来司法权都在他们的掌握之中是他们用来对付百姓的武器。现在这把武器被朱祁钰夺走了反而将矛头对准了他们这些官员能安心吗？
可以说改组行政部门是麻烦最大的事情。在朱祁钰之前大明的行政权主要集中在了以吏部为的中央六部手里其中户部总管天下户籍田土资源等。礼部总管礼仪祭祀以及外交。兵部总管军队事务。工部总管军器制造防洪防汛道路建设等。刑部总管司法等。
现在将司法大权分了出去且皇帝一手掌握了兵权而商人也获得了更大的权利。因此兵部公布刑部这三部已经名存实亡了！另外吏部作为总管官员人事安排的部门在朱祁钰的新政府中是没有任何地位的（这也是为了防止像王直这样的人出现）礼部更是没有任何的价值。中央六部的职权其实已经被削弱了很多！正是在这一基础上朱祁钰再次分化各部门的权力解散了六部成立了十五个新的部门！
这十五部是内务部外交部经济部国防部工业部农牧部商贸部户籍部水利桥梁部警察部帝国安全部（秘密警察部门）教育文化部科技部医疗卫生部以及税务部。虽然以现在的眼光来看这十五个部门还不完善其中很多部门负责了多方面的事务。后来不到一百年中央政府的部门就已经扩大到了二十二个部！不过在当时看来朱祁钰这么明确的细分中央政府的权力这绝对是破天荒的事情！
当然让很多人感到惊讶的事情还有。在设立了这十五部之后朱祁钰还再次打破了太祖皇帝定下的规矩从新设立丞相只不过这时候