兵（掌军官选任与军队训练）、度支（掌国库）治事，每曹设尚书第三品。尚书之下设侍郎、郎中等官，有殿中、吏部、驾部、金部、虞曹、比部、南主客、祠部、度支、库部、农部、水部、仪曹、三公、仓部、民曹、二千石、都官、中兵、外兵、都兵、别兵、骑兵、考工、定科共二十五郎，协助尚书分领诸务。中书省中书监、中书令，俱为第三品，但是中书监地位较中书令为高。曹*封魏王，于魏国置秘书令、秘书丞，管理机要档案并起草文书。曹丕称帝后，改秘书令为中书令，另置中书监，置官署称中书省。中书省掌机密与草拟诏令，遇有机密事宜或紧急事务，中书省直接出诏令交有关官员执行，权力日渐加重，魏明帝时号称“专任” 。属官有通事郎，第五品，后改为中书侍郎（或作中书郎），掌起草诏命。侍中寺侍中寺，汉灵帝熹平六年（177年）置，以侍中与给事黄门侍郎为长官，掌门下诸大夫、郎。曹魏以侍中为主官，第三品，置4人，以其中资历深的一人为祭酒。侍中同时也是加官的一种，作为加官授予的侍中没有人数的限制。侍中的主要职务就是陪侍皇帝左右，随时规谏得失，同时作为门下主官节制其他各类皇帝侍从。曹魏门下诸官有：散骑常侍，第三品。此官的前身是西汉的散骑、常侍和东汉的中常侍三种官职，曹魏合并为散骑常侍，置四员，年资深的为祭酒。散骑常侍也用为加官。给事中，第五品。西汉为加官，掌顾问应对，位在常侍下；东汉废此官，曹魏复置，或为正员，或为加官，无定员。奉车都尉，掌乘舆车驾。驸马都尉，掌副马。骑都尉，掌羽林从骑，皆第六品。这三都尉在汉时均属光禄勋，曹魏却是加官。太中大夫、中散大夫、谏议大夫、议郎皆第七品。曹魏时均脱离光禄勋，改隶侍中，掌顾问应对。秘书监秘书监，第三品。管理艺文图籍，下设秘书丞，第六品；秘书郎，校书郎，第八品。九卿曹*建魏国之初，因为不能与天子匹敌，所以只设立六卿。曹丕称帝后，沿东汉制度置九卿。曹魏九卿与汉朝相比，除了职权大大缩小之外，最主要的变化是将光禄勋所属的文职侍从官全部改隶侍中，光禄勋仅仅管理武职侍从官。此外，曹魏非常重视屯田，在光禄勋诸中郎将之外特设屯田中郎将，下隶典农校尉、典农都尉分驻各地负责屯田事务。曹*立曹丕为储的时候，任命他为五官中郎将，名义上是光禄勋属官，但副丞相以统领百官。曹丕称帝后废。
曹魏地方官制三国时代，由于战争的需要，地方官员往往兼领军队，指挥作战，所以他们的权力较前代膨胀了很多。相对于地方官员的强势，中央政府对地方的约束力并不总是可以保持，尤其是在三国边境和反复争夺的地区。三国时代，曹魏、蜀汉、东吴均实行州、郡、县三级制。州制度曹*以司隶校尉所辖地区置司州，这是十三州中最后正式命名的州。司州辖三辅、三河、以及弘农等七郡。司隶校尉的属官有参军、都官从事、功曹从事、诸曹从事、部郡从事、武猛从事、督军从事、主簿、录事、门下书佐、省事、记室书佐、诸曹书佐等。司州的设置在曹丕称帝之后延续了下来。司州之